A Haqqani Network terrorista csoport 2004-2005 között kezdett megjelenni az Afganisztánban és Pakisztánban működő hírszerző ügynökségek jelentéseiben. A hálózat nevéhez fűződik a szovjet csapatok ellen harcoló Jalaluddin Haqqani helyszíni parancsnok neve.
A szovjet csapatok afganisztáni tartózkodása alatt Jalaluddin Haqqani híres helyszíni parancsnok volt, őt az Egyesült Államok Központi Hírszerző Ügynöksége támogatta, pénzügyi segítséget nyújtva.
A szovjet csapatok kivonulása után az afganisztáni polgárháború folytatódott. Haqqani több nagy műveletben vett részt, tekintélye jelentősen megnőtt. 1992-ben részt vett a harcban álló felek közötti béketárgyalásokon, majd Afganisztán igazságügyi minisztere lett és négy évig töltötte be ezt a tisztséget.
Miután Kabul 1996-ban elfoglalta a tálibokat, Haqqani elállt mellettük, és kinevezték határügyi miniszterré. A gyakorlatban ez oda vezetett, hogy teljesen ellenőrzése alatt állt Paktia tartomány, amely az al-Kaida kiképzőtáboroknak adott otthont, amelyeket később az amerikaiak elpusztítottak. Az amerikai tálibok elleni amerikai hadművelet megkezdése után Haqqani megkezdte a fegyveres erők irányítását, de nem tudott ellenállni a betolakodóknak. A tálibokat legyőzték, Haqqani gerillaháborút kezdett, és az amerikaiak hamarosan a tálibok hat legkeresettebb terroristája közé nevezték.
Haqqani akciói a kormányerők és az amerikai hadsereg ellen nagyon sikeresek voltak, a 2000-es évek közepe óta az afganisztáni jelentések kezdték megemlíteni a "Haqqani Network" -et, amely jelezte ennek a hadvezérnek a megnövekedett befolyását. 2006 óta Haqqanival együtt fia, Sirajuddin (Siraj) irányítja a hálózatot. 2007 óta Siraj volt az, aki az apja egészségi állapotának romlása kapcsán irányította a csoportot. A tálibokkal szoros kapcsolatban álló Haqqani terrorista csoport ennek ellenére önállóan működött, és soha senkinek sem adott alárendelést.
Hamarosan a "Haqqani Network" vezetése már magában foglalta az alapító családjának több tagját és számos helyszíni parancsnokot, a csoport Afganisztán több tartományát ellenőrizte. 2008 óta a csoport kezdett öngyilkos merénylőket használni terrortámadások végrehajtására, az amerikai hatóságok kezdték úgy látni, hogy ez jelentette a legnagyobb veszélyt az afganisztáni amerikai csapatok számára. A hírszerző szolgálatok szerint a hálózat tagjainak száma 2010-ben 4-15 ezer fő között mozgott. A csoport zárt jellege miatt nehéz volt pontosabban megbecsülni a fegyveresek számát.
2008 óta az Egyesült Államok felvette a csoport alapítójának, Siraj Haqqaninak a fiát a terroristák listájára, 2009 óta pedig 5 millió dollár jutalmat hirdettek a róla szóló információkért. A következő években Nasiruddin Haqqani, Khalil al-Rahman Haqqani és Badruddin Haqqani felkerült a terrorista listára.
Az amerikai hatóságok sokáig nem merték hivatalosan bekapcsolni a "Haqqani Hálózatot" a terrorista csoportok számába, mivel továbbra is abban reménykedtek, hogy megállapodásra jutnak egy ilyen befolyásos mozgalom vezetőivel. Az ország hírszerző szolgálatai még találkozókat is tartottak a hálózat képviselőivel, de nem sikerült megállapodást kötniük.
A helyzet végül 2011 szeptemberében tisztázódott, amikor a Haqqani-hálózat terroristái megtámadták a NATO erők parancsnokságát és az Egyesült Államok kabuli nagykövetségét. 16 ember lett a támadás áldozata. Világossá vált, hogy nem lehet megállapodni a terroristákkal, és 2012 szeptemberében bejelentették, hogy az Egyesült Államok felvette a Haqqani Hálózatot a terrorista csoportok listájára.